着他一起到大兴善寺出家（编按：大兴善寺是玄奘法师的译经场），庙里知道窥基要来出家，所以敲钟击鼓来迎接他，窥基一听到钟鼓的声音，豁然大悟：“啊！原来我就是那个老修行，来帮助玄奘法师弘扬佛法，”于是乎把后面的三车遣回去，什么都不要了。所以后人，称窥基为三车祖师。

玄奘法师取回的《唯识三十颂论》有十家，玄奘法师皆译为华文，按照论中的意思，一字不减，一字不添，照原意译出。此时窥基担任整理论文，玄奘法师将十家之论译完之后，窥基要求玄奘法师：“这十家的论，各有其长，各有其异，若不统一，令今后学者，有歧路亡羊之苦恼，不如去其糟粕，留其精华，合成一本，令今后研究唯识的人，获得统一的结论。不用浪费时间，而得到法要。”玄奘法师同意他的见解是正确的，所以产生一本唯识论，即是现在《三十颂唯识论》。后来玄奘法师又传授他“因明学”，成为唯识专家，宣扬唯识思想为宗旨，成为当代大德，为“唯识宗”第二祖。

玄奘法师译籍中标明窥基笔受的，有《成唯识论》十卷、《大般若经》六百卷、《辨中边论颂》一卷、《辨中边论》三卷、《唯识二十论》一卷、《异部宗轮论》一卷、《阿毗达磨界身足论》三卷。其中特别值得注意的，是《成唯识论》的翻译。这是一部解释世亲所造《唯识三十论》而属于集注性质的论书，是中国传译瑜伽学一本十支中的主要一支。世亲造《三十颂》时，没有造释就去世了，后经亲胜、火辨等诸论师相继作释。

玄奘法师在印度，将着名的十大家的注释都搜集了回来。开始翻译的时候，拟将十家注释各别分译。

但不久，弟子窥基就向玄奘法师建议：将十家的注释糅合起来，成为一部，作出定解，以免后人无所适从。玄奘法师同意他的建议。窥基自己说这一部译典是“商榷华梵，甄权重轻，陶甄诸义之差，有叶一师之制”。对于十家疏义，采取了护法的注释为主，加以抉择组织。这种糅译的体裁是窥基独创的，他在《唯识枢要序》里说：“虽复本出五天，然彼无兹糅释，直尔十师之别作，鸠集尤难，况更摭此幽文，诚为未有”。可见他对于本论的译成，是有创造性的贡献的。《唯识二十论》，原有后魏瞿昙般若流支和陈真谛的两种译本。窥基《唯识二十论述记自序》说：“今我和上三藏法师玄奘佼诸梵本，睹先再译，知其不闲奥理，难具陈述……基受旨执笔……删整增讹，缀补纰阙，既睹新本，方类世亲”。这段话是他对于佛典新、旧译本优劣的总评，也说明了新译是从那些方面来校正旧译的。

而大唐太宗皇帝李世民因天竺国王云大唐之事，命云骑梁怀儆，持节往抚。当时的印度摩羯陀王尸罗逸多召问国人道：“从古到今，曾有摩诃震旦使人，得来我国否？”

其国人皆答言无有。

印度王尸罗逸多道：“中国就是摩诃震旦。今有使到此，理应出迎。”

于是尸罗逸多乃出郊恭迓唐使，膜拜受诏，戴诸顶上。复遣使随怀儆入朝，献入火珠郁金菩提树等物。太宗皇帝李世民亦厚赏来使，遣令西归。且命玄奘法师翻译佛经，玄奘法师有徒数十人，日夕同译，成七十五部，得千三百三十五卷。后人作《西游记》，即借玄奘事，以作寓言，看官幸勿为所迷。到了贞观二十二年，尸罗逸多已是去世，国内大乱，遗臣阿罗那顺，自立为主。

唐朝廷未曾闻知，但因天竺不通闻问，已是数年，乃遣王玄策西行，蒋师仁为副。甫入天竺境内，那阿罗那顺，竟然发兵来击唐使。王玄策从骑，不过数十名，怎能抵挡得住？还算从骑奋力接仗，才令王玄策、蒋师仁两人，得脱身走吐蕃。

从骑尽行战死，片甲不留。

吐蕃赞普弄赞，已经与唐室和亲。闻唐使为天竺所逐，遂派遣士兵千人出兵援助。王玄策又檄召邻部，共同讨伐天竺。泥婆罗国，亦发兵七千骑来会，当由王玄策及蒋师仁，部勒成行，兼程南下，直抵茶镈和罗城，猛攻三月，血薄上登。

守兵开城溃散，被王玄策等督众追击，杀死了三千人，还有一大半溺死江中。

王玄策等乘胜入中天竺，阿罗那顺弃国东奔，向东天竺乞援，再收集散卒，来攻打王玄策。

王玄策令师仁为先锋，自为后应，与阿罗那顺对垒争锋。阿罗那顺不知兵法，一味蛮斗，蒋师仁遂用了一条埋伏计，诱他入伏，伏军齐发，把阿罗那顺团团围住。

阿罗那顺上天无路，入地无门，只好束手受缚。余众除被杀外，多半乞降，阿罗那顺妻子，寓居乾陀卫，尚拥着部众万人，阻险自守。蒋师仁率众士兵进攻，守兵又复大溃，撇下阿罗那顺的妻孥，均被师仁拘系而来。于是远近城邑，望风输款，共得五百八十余所。

东天竺王尸鸠摩，也感到惶恐得很，忙送牛马三万头犒师，此外尚有弓刀缨络等物。王玄策、蒋师仁，方才回军，执送阿罗那顺等，献俘阙下。太宗皇帝李世民大喜，授王玄策朝散大夫，召入阿罗那顺，责他拒绝天使，罪应加诛。因而思推广皇恩，于是特开法网，待以不死。